美国疾病预防控制中心（CDC）发起了一个联盟，启动了一个全国测序实验室网络，这将加快SARS-CoV-2序列数据在公共领域的发布。 快速释放开放型冠状病毒序列数据将有助于指导 Covid-19 公共卫生应对措施，推动创新和发现，并加深对这一流行病和未来流行病的了解。
本篇 用于公共卫生应急响应，流行病学和监视（SARS）的SARS-CoV-2测序 财团，这将大大扩展其使用范围 全基因组测序（WGS） 的COVID-19病毒。 SPHERES将向公共卫生应对小组提供一致的实时序列数据，以调查全国的COVID-19病例和群。
这个新的财团将帮助他们更好地了解该病毒如何在全国及当地社区传播。 反过来，更好的数据将帮助公共卫生官员中断传播链，预防新的疾病病例，并保护和挽救生命。
“美国是先进的快速基因组测序的世界领导者。 我们的公共，私人，临床和学术公共卫生实验室之间的协调努力将在理解SARS-CoV-2的传播，进化和治疗方面发挥至关重要的作用。 我相信，我们最优秀，最熟练的人才将共同努力，以帮助我们挽救今天和明天的生命。”疾病预防控制中心主任罗伯特·雷德菲尔德（MD）
跟踪COVID-19病毒的演变
基因组序列数据可以提供对SARS-CoV-2生物学的空前洞察力，SARS-CoV-19是引起COVID-XNUMX的病毒，并有助于确定流行病的变化格局。 通过对美国各地的病毒进行测序，疾病预防控制中心和其他公共卫生部门可以监视病毒的重要变化，并使用此信息来指导接触者追踪，公共卫生缓解措施和感染控制策略。
SPHERES联盟是一项雄心勃勃的工作，旨在在全国范围内协调SARS-CoV-2基因组测序，将数十个较小的个体工作组织到一个单一的分布式实验室，机构和公司网络中。 该联盟整合了40个州和地方公共卫生部门，几个大型临床实验室以及遍布联邦政府，学术界和私营部门的超过二十个合作机构的专业知识，技术和资源。
SPHERES将建立最佳实践和共识数据标准，加速开放数据共享，并建立资源和专业知识库，以帮助将尖端技术带入国家COVID-19应对方案。
SPHERES数据已打开，共享
联盟成员共同致力于快速开放序列共享。 他们计划将所有有用的序列数据提交到国家医学图书馆国家生物技术信息中心（NLM / NCBI），全球禽流感数据共享倡议（GISAID）以及其他公共序列存储库的公共存储库中。 这将有助于确保来自美国各地的病毒序列数据可快速用于公共卫生决策，并可供世界各地的研究人员免费使用。
财团成员包括：
联邦机构和实验室
先进的分子检测办公室疾病控制与预防中心
阿贡国家实验室
国防卫生局 全球传染性 疾病 监控
食品和药物管理局
劳伦斯伯克利国家实验室
洛斯阿拉莫斯国家实验室
国立过敏与传染病研究所，基因组与先进技术办公室
国家标准与技术研究所
国家医学图书馆国家生物技术信息中心
沃尔特里德陆军研究所
州/地方公共卫生实验室
亚利桑那
加利福尼亚州
特拉华
哥伦比亚特区
佛罗里达
夏威夷
缅因州
马里兰州
马萨诸塞
密歇根州
明尼苏达
北卡罗来纳
北达科他州
内华达
新墨西哥
纽约
犹他州
弗吉尼亚州
华盛顿
威斯康星
怀俄明
学术机构
贝勒大学
美国康奈尔大学
Fred Hutchinson癌症研究中心
西奈山医学院
纽约大学
北亚利桑那大学
布法罗大学
美国加州大学伯克利分校
美国加州大学戴维斯分校
美国加州大学欧文分校
美国加州大学洛杉矶
加利福尼亚州，旧金山大学
加州大学圣克鲁兹分校
University of Chicago
马里兰大学
美国明尼苏达大学
内布拉斯加大学
新墨西哥大学
University of Washington
耶鲁大学
企业
雅培诊断
生物梅里埃
颜色基因组学
银杏生物工厂
DNA鉴定
Q电话
美国控股实验室公司
一本法典
牛津纳米孔技术
太平洋生物科学
Qiagen公司
任务诊断
生命科学
公司名称仅供参考，此处所包含的名称并不表示美国疾病控制与预防中心对公司或其任何商业产品或服务的认可。
非营利性公共卫生或研究机构
公共卫生实验室协会
比尔和梅林达·盖茨基金会
博士学院
陈扎克伯格生物中心
克雷格·文特学院
公共卫生基因组流行病学联盟
斯克里普斯研究
杰克逊实验室
北方转化基因组学研究所
沃尔德基金会
在过去的六年中，疾病预防控制中心的高级分子检测办公室计划已在联邦和州公共卫生实验室进行了投资，以扩大病原体基因组学和其他先进实验室技术在传染病监测和疫情应对中的应用。 当前的财团投资旨在拯救SARS-CoV-2大流行中的生命，并为美国和世界做好应对未来大流行的准备。
要了解有关基因组测序或CDC在先进分子检测中的工作的更多信息，请访问 https://www.cdc.gov/amd/
