CDC确认在一月份已经在美国检测到COVID-19

CDC确认在一月份已经检测到冠状病毒
CDC确认在一月份已经检测到冠状病毒

从21年23月2020日至14月2019日,公共卫生机构检测到19例美国1,2年冠状病毒病(COVID-26),均与从中国旅行有关(13)。 3月28日,在加利福尼亚州的一名居民中确认了第一例与旅行无关的病例,该患者于4,5月2日生病(19)。 两天后的XNUMX月XNUMX日,在华盛顿州确认了第二起与旅行无关的案件(XNUMX)。 对这四个方面的检查可以洞悉在发现这两种情况之前将SARS-CoV-XNUMX(一种导致COVID-XNUMX的病毒)引入美国的时间以及早期传播的时间。

首先,根据受大流行初期影响的县的急诊室记录进行的综合监测未显示19月28日之前对COVID-2样疾病的就诊次数增加。其次,回顾性检测了SARS-CoV-11,000对大约1个呼吸道标本的检测从20月18日开始的美国地点在9月2日之前没有发现阳性结果。第三,对早期病例的病毒RNA序列的分析表明,从中国直接或间接进口的单一病毒谱系在XNUMX月XNUMX日至XNUMX月XNUMX日开始在美国传播。来自欧洲的数个SARS-CoV-XNUMX进口。

最终,发生了三起案件,一起发生在6月17日死亡的加利福尼亚州居民中,另一起发生在11月19日去世的同一县的另一名居民中,第三起发生在太平洋游轮上的一名身份不明的乘客或船员XNUMX月XNUMX日,旧金山证实了XNUMX月初之前该病毒的秘密传播。 这些数据表明,在发现前两个与美国非旅行相关的病例之前,就已经开始了持续的社区传播,这可能是由于XNUMX月下旬或XNUMX月初从中国进口了单一病毒谱系,随后又从欧洲进口了几次。 XNUMX月之后,COVID-XNUMX在美国各地的广泛出现凸显了强大的公共卫生系统对迅速应对新出现的传染病威胁的重要性。

症状监测

通过国家综合症状监测计划,美国公共卫生机构从美国4,000个州和哥伦比亚特区约47家医疗机构的急诊部门接收实时数据。 在14个社区早期获得社区COVID-19病例的县中,未观察到类似COVID-19的疾病(发烧和咳嗽或呼吸急促或呼吸困难,或冠状病毒诊断代码列表)的比例显着增加。 28月XNUMX日之前。

急性SARS-CoV-2感染的监测西雅图流感研究(5)从2018年2020月开始监测西雅图都会区的急性呼吸道疾病。2年2月下旬,该研究开始使用逆转录聚合酶链反应(RT- PCR)测试SARS-CoV-28。 在24月5,270日从1月20日收集的标本中检测到SARS-CoV-5的第一个阳性实验室结果。在此检测之后,对先前收集的身份不明的标本进行了追溯测试,以检测该病毒。 在6月2020日至21月21日(1,255)期间收集的0.6个呼吸道标本中没有阳性结果(T. Bedford,弗雷德·哈钦森癌症研究中心,华盛顿州西雅图,个人通讯,29年1,862月1.6日)。 在这些回顾性测试样本中,第一个测试阳性的样本已于2月497日收集。在19月24日开始的一周内,25个样本中的八个测试了阳性(2,620%),在接下来的一周中,测试了19个样本中的29个(2%)正。 两个流感疫苗有效性研究网络位于六个州(密歇根州,宾夕法尼亚州,田纳西州,德克萨斯州,华盛顿州和威斯康星州)的地点,通过RT-PCR回顾性分析了来自急性呼吸道疾病患者的SARS-CoV-22呼吸道标本。 在华盛顿现场,2020月0.2日至3,000月18日收集的1个标本中没有一个呈阳性。 第一个测试结果呈阳性的样本于31月2日收集。在其他五个地点(密歇根州的安娜堡和底特律;宾夕法尼亚州的匹兹堡;德克萨斯州的坦普尔;威斯康星州的马什菲尔德;田纳西州的纳什维尔),20月份没有收集到XNUMX个样本XNUMX月XNUMX日至XNUMX月XNUMX日,SARS-CoV-XNUMX呈阳性。 截至XNUMX年XNUMX月XNUMX日,在XNUMX月XNUMX日至XNUMX月XNUMX日期间从新疫苗监视网络†入组的,年龄小于XNUMX岁的儿童和青少年中收集的大约XNUMX个样本中,有四个(<XNUMX%)检测出SARS-CoV-XNUMX呈阳性。 最早的阳性结果是XNUMX月XNUMX日在西雅图采集的标本。

系统发育分析

对西雅图地区COVID-2早期病例中SARS-CoV-19的基因组多样性的分析发现,大多数病毒属于单个进化枝(华盛顿州进化枝),据估计,其最近的共同祖先大约存在于大约一个进化枝之间。 18月9日和1月19日(点估计= 15月4日)。§该祖病毒的预测基因组序列与美国首例进口COVID-2病例的序列一致,该病例发生于一名从中国武汉抵达西雅图的男子。 ,于XNUMX月XNUMX日发病,并在XNUMX天后患病。 但是,华盛顿州进化枝也可能是由另一名患有SARS-CoV-XNUMX感染者的病毒以相似或相同的序列引起的。 对XNUMX月至XNUMX月中旬在加利福尼亚州和美国东北部的病毒进行的分析表明,有几次病毒进口,主要是从欧洲进口,然后是在美国内部的病毒传播。

没有相关旅行史的人的已知病例

26月19日之前,加利福尼亚州圣塔克拉拉县发生了31例著名的COVID-6病例:13例是17月XNUMX日生病并于XNUMX月XNUMX日死亡的妇女,另一例是XNUMX月XNUMX日至XNUMX日在家里死亡的无关男性。 在他们去世前的几周,他们都没有进行过国际旅行。 通过在CDC上从这些患者的死后组织标本中进行RT-PCR检测,检测到SARS-CoV-2 RNA。 这些死亡由医学检查员确认为COVID-19相关死亡。 对这些案件的调查正在进行中。 大公主号游轮连续两次航行期间发生了COVID-19的暴发(7)。 这些疫情爆发的病毒基因组序列位于华盛顿州进化枝内,这表明感染该病毒的乘客或机组人员于11月XNUMX日离开旧金山港口进行往返航行时正在船上。 该人的身份未知。 讨论来自这些不同数据来源的信息表明,在从中国进口SARS-CoV-2之后,2月下半月至XNUMX月初之间,美国SARS-CoV-XNUMX的社区传播有限。 这种进口引发了华盛顿州的宗族的血统,随后又扩散到整个西雅图都会区,甚至可能扩散到其他地方。 随后在2月和XNUMX月从欧洲进口了几次SARS-CoV-XNUMX。 不知道美国有多少 感染发生在28月和XNUMX月,但是XNUMX月XNUMX日之前的总体疾病发病率太低,无法通过急诊科的症状监测数据检测到。 进口病毒进入美国的日期和携带者的身份也未知。 最早的报道来源可能是美国 COVID-19案,发生于19月15日从中国武汉返回中国后于8月XNUMX日患病的一名华盛顿男子; 从该人身上分离出的病毒的基因组序列与该人可能是华盛顿州进化枝的来源是一致的,尽管对该案进行的接触调查的彻底性和未发现继发病例的情况都与此相反(XNUMX)。 但是,随后发表的报告表明,SARS-CoV-2感染通常是无症状的,并且传播可以在症状发作之前发生(9)。 症状前传播的可能性至少会引起另外三种与这种情况有关的潜在情况:1)患者的接触者之间可能发生了一种或多种继发的无症状感染,这些进一步导致了未被检测到的病毒传播; 2)该名男子可能在症状发作之前就已经感染了接触者(当时无法通过建议的标准接触者调查确定这种接触); 或3)他和至少一个其他人在从武汉出发的同一航班上被另一名旅客感染,而其他被感染者未发现的传播也引起了华盛顿州的进化论。 这些情况中的哪一种(如果有的话)可能永远不会被知道。 鉴于当时SARS-CoV-2的全球系统发育多样性有限,华盛顿州的进化枝大约是在同一时间被另一个陌生人进口到美国的。 此处没有提供血清学测试的结果,因为血清学(即测试SARS-CoV-2抗体)可能是检测新出现的病毒的相对不敏感的方法,尤其是在随机采集标本而不是从标本中采集时最有可能被感染的人(例如,对门诊或住院的急性呼吸道疾病患者进行病毒检测),并且由于血清学检测通常无法达到100%的特异性,除非可以使用某种形式的确认检测。 例如,在西雅图大都会地区(人口3.5万)进行的假设性血清学调查显示,在最初的3,500次感染后,其血清阳性率为0.1%,而使用特异性为99%的测定法则可能会产生假阳性在十倍于样品。 尽管如此,血清学调查仍可用于追踪一旦确定的大流行病进展,并具有检测所有感染的潜在优势,而与症状特征无关。 本报告中的发现至少受三个限制。 首先,这里提供的数据是回顾性的。 尽管它们在地域上是多种多样的,但它们不能提供确定的传播情况,就象发现病毒后立即进行广泛的检测所提供的那样。 其次,引用的某些研究,可能还有其他研究正在继续进行回顾性测试,并可能发现比本报告中介绍的病例更早的病例。 最后,全球SARS-CoV-2在XNUMX月和XNUMX月初的相对系统同源性限制了从基因组分析中可以推断出的结果。 很少有国家避免进口和持续传播COVID-19。 在美国,SARS-CoV-2在从中国,欧洲和其他地方多次进口后,正在广泛传播。 全美都在采取措施 公共卫生系统,以改善SARS-CoV-2活动的指标,包括扩大急诊部门之间的症状监测以及增加对SARS-CoV-2的检测。 考虑到美国大部分地区的可能性

#重建旅行

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首席作业编辑是 Oleg Siziakov

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