结直肠癌患者的新研究

Caris Life Sciences® 的研究结果将提供更深入的了解，即与药物暴露程度相关的基因肿瘤表达（按 p53 状态分层）与用于治疗转移性结直肠癌 (CRC) 的常见化疗方案的临床结果相关。 这些结果将在 2022 年 8 月 13 日至 2022 日在路易斯安那州新奥尔良举行的 XNUMX 年美国癌症研究协会 (AACR) 年会上公布。

由 Wafik El-Deiry 领导的题为“基于 p53 状态和 FOLFOX、5-FU、奥沙利铂或伊立替康治疗个性化的结直肠癌患者的预后和预测药物诱导基因特征”（摘要#1231）的海报研究, MD, Ph.D., FACP，布朗大学 Legorreta 癌症中心主任，Warren Alpert 医学院副院长，Caris 精准肿瘤学联盟 (POA) 成员。 Caris 的 POA 是一个不断发展的全球领先癌症中心网络，它们合作推进精准肿瘤学和生物标志物驱动的研究。 这项工作由布朗大学 EL-DEIRY 实验室的病理学研究生 Lindsey Carlsen 在新奥尔良展示。

本研究的目的是确定用于 CRC 的化学疗法的预测性生物标志物。 该研究使用 CRC 细胞系来鉴定 5-氟尿嘧啶、伊立替康或奥沙利铂治疗后的差异表达基因，并根据 p53 状态对特征进行分层。 从这些体外研究中，研究人员随后检查了这些基因和基因特征是否可以预测 CRC 患者化疗后的结果（FOLFOX、5-氟尿嘧啶、伊立替康或奥沙利铂）。 Caris Life Sciences 通过 DNA/RNA 下一代测序分析了 2,983 个野生型和 6,229 个功能丧失的 p53 CRC 患者样本。 从保险索赔数据和 Kaplan-Meier 估计中推断出真实世界的生存结果。 预后和非预后基因表达对特定药物治疗后的生存结果都有显着影响。

“与单个转录本相比，这项研究有助于我们了解基因特征在展示增强的预测能力方面的重要性，”El-Deiry 说。 “这项研究将基础研究和临床研究联系起来，使我们能够更好地了解哪些疗法更有可能使 CRC 患者受益。” 研究发现，与药物暴露相关的基因的肿瘤表达可以预测化疗治疗后的结果：

• 高 EGR1 和 FOS mRNA 独立预测野生型 p53 肿瘤患者对 FOLFOX 的反应。

• 低CCNB1 mRNA 与具有TP53 功能丧失突变的肿瘤的CRC 患者的良好预后相关。

• BTG2 的低表达预示着MSI-High TP53 突变肿瘤患者的预后较好。

• 与单个转录本效应相比，基因特征可能显示出增强的预测能力。

Caris 首席医疗官 W. Michael Korn 医学博士说：“Caris 专注于可以预测患者对最新疗法的反应的生物标志物，以及 FOLFOX 等经过验证的真正化学疗法。” “我们很高兴看到 Caris 开发并继续取得进展的巨大多组学数据和分析工具赋予了转化研究能力。”

Caris 的全面分子分析评估全外显子组 (DNA)、全转录组 (RNA) 和蛋白质表达，提供无与伦比的资源和理想的路径来进行转化研究，以加速发现以进行检测、诊断、监测、治疗选择和药物开发以改善人类状况。

Caris 将提供更多研究数据，证明精准医学和分子谱分析在癌症治疗中的关键作用。 从 8 年 2022 月 XNUMX 日开始，所有演示文稿都将通过 Caris 的网站在线提供。

其他演示文稿揭示了综合分子分析的影响和潜在的临床可操作性

• 浸润性乳腺癌中FGF/FGFR 改变的综合表征（摘要#5793）FGFR 信号传导对癌细胞增殖、迁移、血管生成和存活至关重要。 在越来越多的癌症类型中，FGFR 改变已成为临床可行的。 本研究评估了超过 12,000 例浸润性乳腺癌中大量 FGF/FGFR 改变的发生率和特征，并强调了 FGF/FGFR 改变在各种组织学和分子亚型以及乳腺癌不同转移部位中的巨大异质性。 此外，在一个大型临床数据库中显示了 FGFR 改变和对治疗的抗性的关联，并具有匹配的分子结果。

• 非小细胞肺癌 (NSCLC) 中 EGFR 亚型的基因组和免疫特征（Abstract #4119）虽然 EGFR 突变 NSCLC 肿瘤通常对 PD-1/PD-L1 抑制剂具有抗性，但一小部分患者可以产生持久反应. EGFR 突变肿瘤表现出显着的分子异质性，然而，EGFR 突变亚型的基因组和免疫特征缺乏明确性，进一步阐明这一点可能有助于识别可能对基于免疫的疗法有反应的患者。 利用新一代 DNA 和 RNA 测序在一大群 NSCLC 肿瘤中产生的多组学分子数据，本研究证实了与大多数 EGFR 突变亚型相关的免疫原性降低，这些突变由包括 PD-L1、TMB 和 CD8+ T 在内的生物标志物表现出来。细胞浸润； 并揭示了与有利的免疫特征相关的罕见 EGFR 突变，这可能表明对免疫治疗有反应。